| Calculated p-values for Wilcoxon signed rank tests. Methods are compared in terms of the observed model quality of the top ranked models for each target. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The null hypothesis is that the method in the row produces models that are equal or lower in quality than those produced by the method in the column, according to the GDT-TS score. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The alternative hypothesis is that the method in the row produces higher quality models than the method in the column, according to the GDT-TS score. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Grey cells highlight values of p < 0.01, indicating significantly better performance of the method in the row compared to that of the method in the column. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A common subset of 42 methods was tested using 123 CASP8 targets. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModFOLDclust | Zhang-Server | ModFOLDv2_0 | RAPTOR | pro-sp3-TASSER | METATASSER | HHpred5 | Phyre_de_novo | MULTICOM-REFINE | MUProt | MULTICOM-CLUSTER | BAKER-ROBETTA | HHpred2 | HHpred4 | MULTICOM-RANK | MUSTER | GS-KudlatyPred | FAMSD | SAM-T08-server | MULTICOM-CMFR | Pcons_multi | ModFOLDv1_1 | COMA-M | PS2-server | circle | 3DShot2 | FEIG | FFASsuboptimal | PSI | Phyre2 | COMA | FFASstandard | FALCON | nFOLD3 | Phragment | mGenTHREADER | Poing | 3D-JIGSAW_V3 | 3D-JIGSAW_AEP | SAM-T06-server | MUFOLD-Server | FOLDpro | Mean p-value | |
| ModFOLDclust | 1.000 | 0.129 | 0.122 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.0298 |
| Zhang-Server | 0.871 | 1.000 | 0.170 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.0486 |
| ModFOLDv2_0 | 0.879 | 0.831 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.0645 |
| RAPTOR | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.266 | 0.243 | 0.281 | 0.120 | 0.090 | 0.061 | 0.055 | 0.022 | 0.019 | 0.016 | 0.009 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.1235 |
| pro-sp3-TASSER | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.735 | 1.000 | 0.549 | 0.420 | 0.375 | 0.225 | 0.086 | 0.076 | 0.118 | 0.100 | 0.021 | 0.009 | 0.006 | 0.001 | 0.012 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.010 | 0.000 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.1606 |
| METATASSER | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.758 | 0.452 | 1.000 | 0.353 | 0.420 | 0.362 | 0.193 | 0.192 | 0.232 | 0.069 | 0.025 | 0.018 | 0.004 | 0.003 | 0.013 | 0.002 | 0.002 | 0.001 | 0.023 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.1697 |
| HHpred5 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.720 | 0.581 | 0.648 | 1.000 | 0.422 | 0.337 | 0.276 | 0.224 | 0.098 | 0.027 | 0.001 | 0.077 | 0.012 | 0.010 | 0.012 | 0.029 | 0.009 | 0.003 | 0.047 | 0.001 | 0.002 | 0.006 | 0.000 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.1796 |
| Phyre_de_novo | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.881 | 0.626 | 0.581 | 0.579 | 1.000 | 0.278 | 0.117 | 0.111 | 0.240 | 0.055 | 0.052 | 0.016 | 0.003 | 0.010 | 0.019 | 0.004 | 0.002 | 0.000 | 0.013 | 0.000 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.1807 |
| MULTICOM-REFINE | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.910 | 0.776 | 0.639 | 0.664 | 0.723 | 1.000 | 0.224 | 0.105 | 0.220 | 0.089 | 0.116 | 0.045 | 0.007 | 0.005 | 0.016 | 0.021 | 0.001 | 0.002 | 0.009 | 0.001 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.2042 |
| MUProt | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.939 | 0.915 | 0.808 | 0.725 | 0.883 | 0.777 | 1.000 | 0.396 | 0.381 | 0.136 | 0.196 | 0.054 | 0.030 | 0.008 | 0.032 | 0.018 | 0.001 | 0.013 | 0.035 | 0.002 | 0.001 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.2465 |
| MULTICOM-CLUSTER | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.945 | 0.924 | 0.809 | 0.777 | 0.889 | 0.895 | 0.605 | 1.000 | 0.613 | 0.251 | 0.209 | 0.042 | 0.068 | 0.017 | 0.085 | 0.025 | 0.005 | 0.009 | 0.009 | 0.005 | 0.004 | 0.008 | 0.000 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.2666 |
| BAKER-ROBETTA | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.978 | 0.882 | 0.768 | 0.902 | 0.761 | 0.780 | 0.620 | 0.388 | 1.000 | 0.299 | 0.238 | 0.174 | 0.085 | 0.137 | 0.141 | 0.040 | 0.014 | 0.024 | 0.072 | 0.066 | 0.008 | 0.015 | 0.001 | 0.006 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.2714 |
| HHpred2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.981 | 0.900 | 0.931 | 0.973 | 0.945 | 0.911 | 0.865 | 0.750 | 0.702 | 1.000 | 0.099 | 0.423 | 0.170 | 0.125 | 0.084 | 0.304 | 0.140 | 0.022 | 0.071 | 0.017 | 0.032 | 0.019 | 0.002 | 0.012 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.3209 |
| HHpred4 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.984 | 0.979 | 0.975 | 0.999 | 0.948 | 0.884 | 0.805 | 0.792 | 0.762 | 0.902 | 1.000 | 0.460 | 0.199 | 0.366 | 0.153 | 0.331 | 0.127 | 0.143 | 0.129 | 0.056 | 0.047 | 0.016 | 0.010 | 0.009 | 0.000 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.3590 |
| MULTICOM-RANK | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.991 | 0.991 | 0.982 | 0.924 | 0.984 | 0.956 | 0.946 | 0.958 | 0.827 | 0.578 | 0.541 | 1.000 | 0.273 | 0.280 | 0.259 | 0.260 | 0.057 | 0.186 | 0.040 | 0.069 | 0.024 | 0.053 | 0.014 | 0.029 | 0.002 | 0.000 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.3625 |
| MUSTER | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.998 | 0.994 | 0.996 | 0.988 | 0.997 | 0.993 | 0.970 | 0.932 | 0.916 | 0.830 | 0.802 | 0.728 | 1.000 | 0.369 | 0.305 | 0.333 | 0.313 | 0.280 | 0.240 | 0.169 | 0.079 | 0.039 | 0.047 | 0.050 | 0.003 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.4136 |
| GS-KudlatyPred | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 0.997 | 0.990 | 0.990 | 0.995 | 0.992 | 0.983 | 0.863 | 0.875 | 0.635 | 0.721 | 0.632 | 1.000 | 0.338 | 0.515 | 0.314 | 0.178 | 0.194 | 0.177 | 0.112 | 0.048 | 0.010 | 0.088 | 0.007 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.4204 |
| FAMSD | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.988 | 0.987 | 0.988 | 0.981 | 0.984 | 0.968 | 0.915 | 0.859 | 0.916 | 0.848 | 0.742 | 0.696 | 0.663 | 1.000 | 0.200 | 0.172 | 0.186 | 0.220 | 0.148 | 0.109 | 0.005 | 0.011 | 0.044 | 0.020 | 0.006 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.4205 |
| SAM-T08-server | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.998 | 0.971 | 0.996 | 0.979 | 0.982 | 0.975 | 0.960 | 0.697 | 0.670 | 0.741 | 0.668 | 0.486 | 0.801 | 1.000 | 0.570 | 0.402 | 0.297 | 0.058 | 0.230 | 0.308 | 0.054 | 0.071 | 0.012 | 0.001 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.4508 |
| MULTICOM-CMFR | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.998 | 0.991 | 0.998 | 0.999 | 0.999 | 0.995 | 0.986 | 0.861 | 0.874 | 0.943 | 0.688 | 0.687 | 0.828 | 0.431 | 1.000 | 0.502 | 0.305 | 0.201 | 0.338 | 0.215 | 0.070 | 0.112 | 0.028 | 0.002 | 0.005 | 0.000 | 0.001 | 0.007 | 0.000 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.4778 |
| Pcons_multi | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 0.997 | 1.000 | 0.998 | 0.988 | 0.992 | 0.977 | 0.978 | 0.857 | 0.814 | 0.721 | 0.822 | 0.815 | 0.599 | 0.499 | 1.000 | 0.506 | 0.310 | 0.364 | 0.286 | 0.088 | 0.284 | 0.060 | 0.007 | 0.010 | 0.002 | 0.001 | 0.006 | 0.001 | 0.003 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.4996 |
| ModFOLDv1_1 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.997 | 0.990 | 0.977 | 0.953 | 0.988 | 0.991 | 0.965 | 0.991 | 0.928 | 0.929 | 0.872 | 0.960 | 0.761 | 0.806 | 0.781 | 0.704 | 0.696 | 0.495 | 1.000 | 0.504 | 0.436 | 0.361 | 0.188 | 0.146 | 0.268 | 0.114 | 0.157 | 0.091 | 0.062 | 0.040 | 0.018 | 0.043 | 0.035 | 0.010 | 0.091 | 0.115 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.5349 |
| COMA-M | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | 0.999 | 0.998 | 0.995 | 0.935 | 0.983 | 0.944 | 0.932 | 0.832 | 0.824 | 0.853 | 0.942 | 0.799 | 0.691 | 0.497 | 1.000 | 0.393 | 0.273 | 0.167 | 0.284 | 0.085 | 0.014 | 0.041 | 0.000 | 0.001 | 0.021 | 0.006 | 0.010 | 0.000 | 0.005 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.5363 |
| PS2-server | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 0.998 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 0.996 | 0.992 | 0.968 | 0.954 | 0.976 | 0.921 | 0.889 | 0.892 | 0.771 | 0.663 | 0.637 | 0.565 | 0.608 | 1.000 | 0.432 | 0.181 | 0.358 | 0.115 | 0.030 | 0.015 | 0.012 | 0.001 | 0.017 | 0.001 | 0.002 | 0.001 | 0.000 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.5475 |
| circle | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | 0.994 | 0.999 | 0.999 | 0.998 | 0.992 | 0.985 | 0.982 | 0.984 | 0.947 | 0.961 | 0.952 | 0.995 | 0.693 | 0.786 | 0.715 | 0.640 | 0.728 | 0.569 | 1.000 | 0.275 | 0.540 | 0.118 | 0.104 | 0.045 | 0.023 | 0.011 | 0.017 | 0.007 | 0.017 | 0.001 | 0.005 | 0.003 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.5735 |
| 3DShot2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 0.998 | 0.990 | 0.987 | 0.953 | 0.991 | 0.989 | 0.947 | 0.930 | 0.912 | 0.813 | 0.833 | 0.820 | 0.726 | 1.000 | 0.610 | 0.267 | 0.083 | 0.125 | 0.010 | 0.035 | 0.054 | 0.015 | 0.035 | 0.002 | 0.014 | 0.006 | 0.002 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.6225 |
| FEIG | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.998 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.998 | 0.995 | 0.988 | 0.991 | 0.972 | 0.951 | 0.912 | 0.956 | 0.930 | 0.889 | 0.716 | 0.855 | 0.717 | 0.643 | 0.461 | 0.391 | 1.000 | 0.554 | 0.204 | 0.352 | 0.091 | 0.125 | 0.303 | 0.007 | 0.212 | 0.032 | 0.102 | 0.010 | 0.020 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.6279 |
| FFASsuboptimal | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.998 | 0.997 | 0.993 | 0.980 | 0.988 | 0.972 | 0.941 | 0.733 | 0.916 | 0.886 | 0.883 | 0.733 | 0.447 | 1.000 | 0.212 | 0.212 | 0.125 | 0.001 | 0.050 | 0.073 | 0.039 | 0.033 | 0.021 | 0.023 | 0.011 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.6492 |
| PSI | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | 0.994 | 0.999 | 0.998 | 0.993 | 0.887 | 0.986 | 0.970 | 0.897 | 0.918 | 0.796 | 0.789 | 1.000 | 0.303 | 0.430 | 0.335 | 0.204 | 0.097 | 0.134 | 0.087 | 0.040 | 0.032 | 0.071 | 0.001 | 0.000 | 0.000 | 0.7133 |
| Phyre2 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 0.998 | 1.000 | 0.999 | 0.999 | 0.999 | 0.995 | 0.991 | 0.844 | 0.959 | 0.985 | 0.956 | 0.875 | 0.649 | 0.789 | 0.698 | 1.000 | 0.267 | 0.232 | 0.213 | 0.271 | 0.082 | 0.090 | 0.013 | 0.089 | 0.090 | 0.000 | 0.000 | 0.000 | 0.7163 |
| COMA | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.998 | 0.909 | 1.000 | 0.988 | 0.977 | 0.990 | 0.909 | 0.876 | 0.571 | 0.734 | 1.000 | 0.318 | 0.432 | 0.298 | 0.360 | 0.305 | 0.244 | 0.149 | 0.212 | 0.005 | 0.000 | 0.000 | 0.7685 |
| FFASstandard | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 0.999 | 0.938 | 0.999 | 0.999 | 0.989 | 0.965 | 0.876 | 0.999 | 0.666 | 0.769 | 0.682 | 1.000 | 0.395 | 0.493 | 0.341 | 0.367 | 0.175 | 0.242 | 0.199 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.7880 |
| FALCON | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | 0.998 | 0.997 | 0.998 | 0.993 | 0.994 | 0.960 | 0.979 | 0.983 | 0.983 | 0.946 | 0.698 | 0.950 | 0.797 | 0.788 | 0.569 | 0.606 | 1.000 | 0.524 | 0.501 | 0.455 | 0.312 | 0.266 | 0.221 | 0.038 | 0.000 | 0.000 | 0.7989 |
| nFOLD3 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 0.982 | 0.994 | 0.999 | 0.993 | 0.985 | 0.993 | 0.927 | 0.903 | 0.730 | 0.702 | 0.508 | 0.477 | 1.000 | 0.467 | 0.347 | 0.321 | 0.327 | 0.297 | 0.014 | 0.000 | 0.000 | 0.8087 |
| Phragment | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.998 | 0.997 | 0.958 | 0.990 | 0.998 | 0.983 | 0.966 | 0.789 | 0.961 | 0.866 | 0.919 | 0.641 | 0.660 | 0.500 | 0.534 | 1.000 | 0.297 | 0.272 | 0.347 | 0.214 | 0.004 | 0.000 | 0.000 | 0.8069 |
| mGenTHREADER | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.965 | 1.000 | 0.999 | 0.999 | 0.998 | 0.968 | 0.967 | 0.914 | 0.910 | 0.696 | 0.634 | 0.546 | 0.654 | 0.704 | 1.000 | 0.551 | 0.240 | 0.317 | 0.003 | 0.000 | 0.000 | 0.8348 |
| Poing | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 0.990 | 0.995 | 1.000 | 0.995 | 0.986 | 0.899 | 0.979 | 0.960 | 0.987 | 0.757 | 0.826 | 0.688 | 0.679 | 0.730 | 0.451 | 1.000 | 0.514 | 0.376 | 0.018 | 0.000 | 0.000 | 0.8530 |
| 3D-JIGSAW_V3 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.909 | 0.999 | 0.999 | 0.997 | 0.994 | 0.990 | 0.977 | 0.968 | 0.911 | 0.852 | 0.759 | 0.735 | 0.674 | 0.654 | 0.760 | 0.487 | 1.000 | 0.449 | 0.044 | 0.000 | 0.000 | 0.8609 |
| 3D-JIGSAW_AEP | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.885 | 1.000 | 1.000 | 0.997 | 0.998 | 0.980 | 0.989 | 0.929 | 0.910 | 0.789 | 0.801 | 0.780 | 0.704 | 0.787 | 0.684 | 0.625 | 0.552 | 1.000 | 0.046 | 0.000 | 0.000 | 0.8680 |
| SAM-T06-server | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | 0.999 | 1.000 | 0.995 | 0.997 | 0.962 | 0.986 | 0.996 | 0.997 | 0.982 | 0.956 | 0.954 | 1.000 | 0.000 | 0.000 | 0.9482 |
| MUFOLD-Server | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 0.000 | 0.9762 |
| FOLDpro | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.000 | 1.0000 |
| Mean p-value | 0.9941 | 0.9752 | 0.9593 | 0.9004 | 0.8634 | 0.8543 | 0.8444 | 0.8433 | 0.8198 | 0.7776 | 0.7574 | 0.7526 | 0.7031 | 0.6650 | 0.6615 | 0.6104 | 0.6037 | 0.6036 | 0.5733 | 0.5463 | 0.5245 | 0.4893 | 0.4877 | 0.4766 | 0.4506 | 0.4015 | 0.3962 | 0.3748 | 0.3107 | 0.3078 | 0.2556 | 0.2360 | 0.2252 | 0.2153 | 0.2171 | 0.1892 | 0.1710 | 0.1631 | 0.1560 | 0.0757 | 0.0476 | 0.0238 | |